一場天災浩劫籠罩著大地，紫魔蘭在人類居住的山谷快速蔓延，帶來無盡的死亡與毀滅。只有花千谷，在花神樹的守護下暫時幸免于難，唯一受到紫魔蘭影響的是由神獸鳳凰帶來的嬰兒，被毒浸的孩子名為牡丹公主。國王和王后違背祖訓，收留了牡丹公主，為她取名，撫養她成人。突如其來的花神樹凋謝，牡丹公主也沉入疾病之中，引發花千谷人心惶惶，請求將牡丹公主送走。 王后為了拯救女兒，毅然向花神樹求助，她自愿舍身進入黑色結界歷經考驗，企圖喚回失落的花魂。但紫魔蘭的力量太過龐大，王后被困其中，而絕望的呼喚也變得杳無音信。十年后，牡丹公主成年，紫魔蘭再度侵襲花千谷，帶來前所未有的劫難。牡丹公主懷著王后的教誨，帶著唯一的希望——花魂種子，踏上了拯救花千谷的危險旅程。她堅信只有戰勝紫魔蘭，才能重現花千谷的昔日繁榮和和平。
